男性的临床表现
男性的临床表现应从尿道观察到整个泌尿生殖道。需要提醒的是：至少50%的男性患者和70%的女性患者没有任何症状。有症状的可表现为以下几种：
一、三男性尿道炎潜伏期平均１～3周，男性患者表现为尿道炎，有尿痛或尿道分泌物。尿痛症状比较轻，有时仅表现为尿道的刺痛和痒感，尿道分泌物为浆液性或黏液脓性，较稀薄，量也较少，有些患者晨起时会发现尿道口有少量分泌物结成痂封住了尿道口（糊口现象）或内裤被污染。体检可见尿道口轻度红肿。
二、前列腺炎患者出现会阴部及其周围轻微疼痛或酸胀感，伴有直肠坠胀感。检查时前列腺呈不对称肿大、变硬或有硬结和压痛。尿中可出现透明丝状物或灰白色块状物，大约半数以上的衣原体前列腺炎患者诉有排精痛。
沙眼衣原体泌尿生殖道感染的判定困难：从临床到化验
三、附睾炎患者常出现不对称的附睾肿大、疼痛、水肿、硬结、局部或全身发热，硬结多发生在附睾的曲细精管，可触及痛性的硬结。有时睾丸也可累及，出现睾丸肿大、疼痛及触痛、阴囊水肿和输精管变粗等（图4）。
四、直肠炎患者多有肛门性交史，包括同性恋男性和异性恋女性，可无任何症状，也可出现肛门疼痛、出血、黏液分泌物和腹泻等。
女性的临床表现
女性需要从宫颈观察到整个生殖道和盆腔，包括泌尿系统和肝周炎。
一、女性黏液性宫颈炎潜伏期平均1～3周，主要表现为宫颈内膜炎，宫颈有充血、水肿、触之易出血，黄色黏液脓性分泌物增多及下腹部不适等症状，阴道壁黏膜正常。也有相当数量的患者症状轻微或无任何临床症状。患者还可伴尿急、尿痛等尿道炎症状。
沙眼衣原体泌尿生殖道感染的判定困难：从临床到化验
二、女性衣原体尿道炎的特点是症状不明显或无症状。仅约50%的患者有尿频及排尿困难，可有尿急，但无尿痛症状或仅有轻微尿痛。尿道口充血潮红，微肿胀或正常，挤压时常有少量蛋黄色分泌物溢出，也可自行溢出少量分泌物。
三、子宫内膜炎患者先有或同时伴有衣原体宫颈炎，临床常可表现为下腹痛和不正常的阴道出血。
四、附件炎常先有或同时伴有衣原体宫颈炎或子宫内膜炎。急性发病时下腹疼痛、压痛、反跳痛或有膀胱刺激症状，常伴发热；病情严重时可有高热、寒战、头痛、食欲不振等；病情较轻时，下腹部可有轻微疼痛，血沉稍快。仅有少数患者可扪及增粗的输卵管或炎性肿块，造成输卵管黏连等后遗症，导致输卵管性不孕。
五、盆腔炎主要表现呈急腹症样，如腹痛、压痛及反跳痛，常伴有发热及腰痛。近一半男性沙眼衣原体泌尿生殖道感染者可以不出现任何临床症状（包括患者自觉症状和医生在体格检查中的阳性发现），75%的女性沙眼衣原体泌尿生殖道感染者可无症状。病情隐匿，导致无法及时诊治，长期的隐匿感染，可导致慢性感染，使治疗更加困难。
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